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藥學系是隸屬於醫學院下的一個科系,以培養藥學領域專門人才為目標。在美國等地,藥學系的學制為五年制,中華民國的藥學系學制為四年制。藥學系主要的專業科目有藥劑學、藥物化學、藥事行政法規、藥學實習等科目。由藥學系畢業的畢業生,可通過國家考試取得執照,成為合法的藥劑師。
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